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新幹線延伸後の並行在来線で貨物輸送機能をいかに維持するかが問われています。
北海道新幹線の札幌延伸に伴い、並行在来線として経営分離が予定される区間（特に函館本線の山線・海線）における貨物輸送機能の維持をどのように確保するかが論点となっています。新幹線開業後、並行在来線はJRから経営分離されることが原則とされていますが、北海道の場合、農産品や工業製品など大量の貨物を本州と結ぶ鉄道貨物ネットワークが当該路線に依存しており、単純な廃線や第三セクター移管では貨物輸送機能が失われるおそれがあります。政府は中間とりまとめを通じて、少なくとも延伸開業時点では海線を維持することで貨物鉄道機能を確保する方針を示しています。一方、議会では国が主導して持続可能な輸送スキームを構築すべきとの意見も強く、誰がコストを負担し、どのような制度的枠組みで機能を維持するかについて議論が続いています。北海道の物流インフラとしての重要性から、地域経済・食料安全保障の観点でも注目される課題です。